W  Laboratorium Mikrobiologii prowadzimy diagnostykę zakażeń układu oddechowego, moczowego, zakażeń inwazyjnych, infekcyjnego zapalenia wsierdzia, gorączki neutropenicznej, zakażeń skóry, tkanek miękkich, miejsca operowanego,  zakażeń związanych z Clostridium difficile. Wykonujemy badania w kierunku nosicielstwa patogenów alarmowych oraz wykrywania serologicznych markerów inwazyjnej choroby grzybiczej.

Wysoką jakość naszych usług zapewniamy  dzięki  zatrudnieniu wysoce kompetentnego personelu, dostosowaniu procedur do aktualnych zaleceń ośrodków referencyjnych,  systematycznej  kontroli  wewnętrznej  oraz korzystaniu z najwyższej jakości sprzętu. Obok klasycznych fenotypowych metod stosujemy również techniki biologii molekularnej - szczególnie w diagnostyce zakażeń u pacjentów w immunosupresji. Jako jedyni w  Wielkopolsce oznaczamy geny karbapenemaz typu NDM, KPC, VIM, IPM i OXA.

Wiarygodność badań wykonywanych w Laboratorium Mikrobiologii potwierdzana jest od wielu lat bardzo dobrymi wynikami w Ogólnopolskim Sprawdzianie Wiarygodności Badań w Mikrobiologii POLMIKRO oraz w międzynarodowym sprawdzianie UK NEQAS (UK National External Qality Assesment Service for Microbiology),  a także certyfikatem ISO 9001: 2008

Laboratorium uczestniczy w pracach Zespołu ds. Zakażeń Szpitalnych, Komitetu Kontroli Zakażeń Szpitalnych, Komitetu Terapeutycznego, bierze udział w licznych krajowych i europejskich programach monitorowania zakażeń szpitalnych i pozaszpitalnych (BiNet, Seq-Net, CDI-Net) oraz w europejskiej sieci monitorowania lekooporności drobnoustrojów (EARS-Net).